0

Ч рез целогеномно секвениране от ново поколение успешно в Националния центъра по заразни и паразитни болести са анализирани 334 клинични проби със SARS-CoV-2. За първи път, при 7 проби от няколко области в България е установен подвариант ВА.2 на Омикрон, съобщават от НЦЗПБ.

Чрез целогеномно секвениране от ново поколение успешно в Националния центъра по заразни и паразитни болести са анализирани 334 клинични проби със SARS-CoV-2. За първи път, при 7 проби от няколко области в България е установен подвариант ВА.2 на Омикрон, съобщават от НЦЗПБ.

Подвариантът на Омикрон е открит в три проби от Бругас, две в столицата и две в Търговище.

За разлика от ВА.1, при ВА.2 отсъства делеция 69-70 в S гена на вирусния геном. Това се отразява в резултатите при скринингово изследване с Real-time PCR по метод с S-gene target failure (SGTF) като насока за установяване на вероятен вариант Омикрон и при тези изследвания вариант ВА.2 може да бъде погрешно интерпретиран като не-Омикрон. По данни на СЗО, присъствието на ВА.2 се увеличава в някои страни.  

При 249 (74,6%) проби се установи вирусен вариант Омикрон, включително подварианти  (BA.*) и при 85 (25,4%) вариант Делта (B.1.617.2) или подварианти на Делта (AY.*). Окончателният анализ за дефиниране на вирусните варианти е извършен с помощта на програма Nextclade v1.13.1. и Pangolin COVID-19 Lineage Assigner v3.1.17.

Пробите са взети от пациенти с COVID-19 в периода 03-20.01.2022 г. и са изпратени от 31 различни лечебни заведения от 21 области на страната. Разпространението на вариантите на SARS-CoV-2 в различни области на страната е представено в таблицата към тази справка.